如何在 3.5 小时内完成无核糖体核酸总 RNA 文库

让 RNA-Seq 制作变得简单
与 Truseq® 文库准备相比，来看减少 100 个步骤可节省多少时间。

1、节省 6 小时以上，简单的文库制备试剂盒
 

Zymo-Seq 无核糖体核酸总 RNA 文库试剂盒较大限度地减少了生成 RNA- seq 总文库所需的试剂和步骤。

（1） 在一天之内将样品送到测序仪，简单的 RNA-Seq 文库制备工作流程

（2）大大缩短动手时间，比 Truseq® 减少 60%
 

与 TruSeq®Ribo-ZeroTM Gold 相比，使用 Zymo-Seq RiboFree 总 RNA 库试剂盒明显减少了移液步骤。 易于操作步骤可让用户在一天之内从收到 RNA 样品到送测序。

2、Probe-free rRNA 去除 与任何生物体兼容
 

任何样品类型使用一个试剂盒，使任何库不含核糖

无核糖体核酸可以从任何样本中去除 rRNA。配对末端测序是在含有 ERCC spikein - Mix 1 (Life Technologies) 的总 RNA-Seq 文库上进行的，无论是否进行无核糖体去除。使用 STAR aligner 对准各自的基因组进行 alige。Read 类是使用 Ensembl GTF 基因生物类型和 RepBase 重复掩码注释的组合来定义的。每个注释类重叠的读取数除以该库中的总读取数，即可计算出每个注释类的读取百分比。

3、35x 少偏表达式配置文件 消除靶外核糖消耗
 

Zymo-Seq RiboFree 总 RNA 库试剂盒中使用的新型无探针技术可显着减少受 rRNA 去除（基于 Ribo-ZeroTM Gold 探针的去除）或 mRNA 富集（Universal Plus poly（A）下拉）影响的基因。
 

免探针，无偏，无核糖，准确的 rRNA 去除

与供应商 i [基于探针的 Ribo-ZeroTM Gold] 和供应商 NG [poly（A）富集] 不同，RiboFree 去除保持了天然表达谱。配对末端测序是在含有 ERCC Spike-In Mix 1（Life Technologies）的通用人类参考 RNA（Invitrogen）制备的文库上进行的，无论是否去除 rRNA。每个文库的测序深度约为 3500 万次读取，并使用 STAR aligner 将读取对与 hg38 人类基因组对齐。用 deseq2 软件包应用 apeglm 作为对数折变收缩相关，确定 rrna 去除对 20004 个蛋白编码基因中的哪一个和转录物中的 ercc 峰有显著影响（p.adj<0.05）。显著受影响的转录本在散点图中表现为彩色点。

RNA-Seq 试剂盒比较表

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