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你的 DNA/RNA 降解了?也许并不是提取的的问题(样品收集和保存的重要性)

人阅读 发布时间:2022-04-02 15:18

在采集样本时候必须保持样品的完整性,因为不合适的保存会直接影响下游核酸提取的质量。此外,未受保护的样本可能由于核酸降解,细胞生长/衰变以及与采集等相关的问题而发生组成成分的变化和偏差。

简化的保存和纯化流程
为解决这一问题,ZYMO RESEARCH 与简石生物将样本采集,保护和核酸提取通过一种试剂 DNA / RNA Shield™来实现。 DNA / RNA Shield™可稳定核酸而无需冷藏(- 80°C),即使在室温下也可保护样品长达 30 天。这就解决了对复杂的储存条件和专门的样本采集过程的要求,同时即使多次冻融样品,也可以很好的保护 DNA / RNA 在采样时的状态。该试剂大大简化了样本收集和核酸提取的过程。它与所有 Zymo Research 或简石生物提取试剂盒兼容,与 RNAlater®等其他防腐剂不同,该试剂不需要在样本处理前将其去除。只需将结合试剂添加到 DNA / RNA Shield™中的样品中,然后进行纯化(图 1)。

图 1:来自受 DNA / RNA Shield™保护的样品的简化工作流程,然后通过 Zymo Research 或简石生物的 DNA 和 RNA 提取试剂盒进行纯化。
DNA / RNA Shield™可应用于多种采集容器,以最好地满足不同的样本需求:血液收集管,粪便收集管,裂解管或拭子采集管等。只要确定好您的样本类型,就会有专门的采集套装。


防止冻融
时间,储存温度和反复冻融都会导致样品稳定性问题。但是,DNA / RNA Shield™可以对样品提供保护,防止这些变化。通过在常温环境下稳定 DNA 和 RNA,DNA / RNA Shield™无需复杂的储存条件和专门的样本采集流程。并且,在较低温度下储存的样品也受到保护,免受冻融的负面影响(图 2)。因此,无论储存条件如何,添加了 DNA / RNA 保护剂的样品可以很好的反应采集当初的原始组成。

图 2:由 DNA / RNA Shield™保护的全血样品冻融后总 RNA profile 稳定。全血样品+/- DNA / RNA Shield™经历> 2 次冻融循环。随后使用 Quick-RNA™全血试剂盒纯化总 RNA 并通过跑胶分析。

在室温下储存时的稳定性
此外,DNA / RNA Shield™可裂解细胞,使核酸酶失活,并用化学方法稳定核酸。例如,从 DNA / RNA Shield™中储存的血液中纯化的 DNA 和 RNA 的分析显示,在环境温度下,在长达 30 天的储存过程中,DNA 或 RNA 水平没有变化(图 3)。

图 3:血液样品中的 DNA 和 RNA 在环境温度下,随时间在 DNA / RNA Shield™中有效稳定。图表显示了从用于 DNA / RNA Shield™的血液样品中分离的 RNA 在不同时间点,针对各种常见靶标的(RT)qPCR 结果。样品一式四份。

保持样品微生物组成
通过粪便样品的微生物组成,可以容易地观察到 DNA / RNA Shield™的作用。如果没有合适的保护,就会引入高度的变异性和偏差,其中一些细菌生长,而其他物种不生长。然而,当 DNA / RNA Shield™添加到样品中时,微生物特征会随着时间的推移而保留,并防止任何变化或偏差(图 4)。尽管有反复冻融,但它仍然提供了一种简单有效的方法,可以在不同温度下稳定 DNA 和 RNA。

图 4:DNA / RNA Shield™保存的粪便样品的微生物组成与未受保护的样品相比。粪便样品的微生物组成(由不同颜色表示)在环境温度下随时间储存,添加和未添加有 DNA / RNA Shield™保护。用 ZymoBIOMICS® DNA Miniprep Kit 提取 DNA,然后进行 16S rRNA 靶向测序。
1病毒灭活

5:添加了 DNA / RNA Shield™可有效灭活病原体 病毒、细菌和酵母可添加了 DNA / RNA Shield™与模拟样本(添加了 PBS)处理 5 分钟。随后滴定通过噬斑测定(PFU)或生长测定(CFU)测定。

01该产品包含 DNA/RNA Shield,已获得美国疾病预防控制中心认证,无需担心样本降解,可在采集地保留样品的基因完整性,以进行敏感的下游分析(例如:下一代测序,RT-PCR 等);可保证样本在常温运输中核酸的稳定,无需冷链运输或特殊的设备,任何类型的样本都可以存储在采样管的 DNA / RNA 保护剂中;可有效裂解细胞,灭活各种核酸酶和传染性微生物(病毒、细菌、真核生物),兼容各种样本保存套装


图 6 保护剂被美国 NASA(航空航天总署) 选为太空实验的样本保存方案



提取保存在保护剂中的样本化 DNA 和 RNA 纯化提取流程
无需去除保护剂
与所有提取试剂盒兼容
完全自动化(推荐简石生物磁珠法试剂盒)

 
血液收集管 微生物和组织裂解管 粪便收集管 口腔拭子收集管


疫情期间简石生物积极承担企业社会责任,密切关注疫情进展,员工加班加点生产,全力保障前线的试剂供应,全力支持前线防疫抗灾团队。其中样本保存液,一次性使用采样拭子,病毒核酸提取试剂盒已发往省市疾控中心,疫区一线医院,第三方检测机构等单位助力疫情。
关于我们
简石生物技术是一家集医用耗材生产,体外诊断试剂,医疗器械生产于一体的高科技公司,公司研发基地位于北京,生产基地位于浙江,拥有6000平方米的十万级净化厂房,通过 ISO13485等体系认证,产品获得 CE,FDA认证,远销欧美等二十多个国家。

已获得医疗器械证产品:
样本保存液,一次性使用采样拭子,核酸提取试剂盒
畅销产品:样本保存液,核酸提取试剂盒,甲基化修饰试剂盒,离心柱,磁珠,离心管,96孔板耗材(匹配自动化设备)

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